Команда Альфа в выделение создаёт выделение в активном слое из канала альфа. Непрозрачные точки полностью выделяются, прозрачные точки не выделяются, частично прозрачные точки выделяются по степени прозрачности. Это новое выделение замещает собой уже существующее выделение. Сам канал альфа не изменяется.

Другие команды этой группы работают похожим образом, только вместо замещения существующего выделения созданным из канала альфа выделением, они или складывают два выделения, или вычитают альфа выделение из исходного, или пересекают альфа выделение и исходным, оставляя только общие точки.