Cómo se sabe: si este es el problema, simplemente leyendo esto ya lo habrá realizado, probablemente, pero para explicarlo de todos modos: a veces la línea parpadeante exterior de la selección es molesta porque dificulta la visión de detalles importantes de la imagen, así que GIMP da la opción de esconder la selección, desmarcando Mostrar la selección en el menú Ver. Es fácil olvidar que se hizo esto.

Cómo resolverlo: si esto no ha hecho saltar ninguna alarma, este no es el problema, y si lo fuera, probablemente ya sabe como solucionarlo, porque no sucede a menos que lo pida explícitamente; de todos modos: vaya al menú Ver de la imagen y si Mostrar selección está desmarcado, márquelo.