При экспорте изображений необходимо помнить, что большинство форматов изображений имеют ограничения. Ограничением изображений в формате jpeg является то, что он не поддерживает прозрачность. При экспорте в формат jpeg GIMP заполняет прозрачные области цветом фона, который по умолчанию является белым.
Чтобы исправить это, необходимо выбрать другой формат изображения, который поддерживает прозрачность, такой как png или tiff.