Команда Очистить удаляет всё из активного выделения. Если нет выделения, то удаляется содержимое активного слоя. Если у активного слоя есть канал альфа, то слой становится прозрачным. Исходный цвет прозрачной области можно вернуть с помощью инструмента «Ластик» в режиме анти-ластика. Если нет канала альфа, то удалённая область заполняется текущим цветом фона.

Очищение выделения не удаляет само выделение. В отличие от команды «Вырезать», команда «Очистить» не помещает удаляемые данные в буфер обмена, и содержимое буфера обмена не меняется.