Se si è attuato un cambiamento su un'immagine di cui in seguito ci si è pentiti, il comando Annulla permette di annullare l'ultimo cambiamento e ripristinare l'immagine allo stato precedente l'operazione. Quasi tutte le operazioni effettuabili su di un'immagine possono essere annullate in questo modo (con l'eccezione di quegli script che disabilitano esplicitamente questa funzione). Più operazioni di annullamento possono essere effettuate in seguito, secondo il numero di livelli di annullamento che siano stati configurati nella pagina Risorse di sistema della finestra delle preferenze. Per ulteriori informazioni sulle sofisticate funzioni di «annullamento» di GIMP, consultare la sezione sugli annullamenti.

Una versione alternativa di Annulla è «Annulla forte», che salta i cambiamenti nella visibilità dei livelli ecc. Questo comando può essere eseguito usando la scorciatoia da tastiera Ctrl+Maiusc +Z.

L'operazione «annullata» non è persa del tutto: può essere ripristinata usando subito il comando Ripeti; ma se in seguito all'annullamento si esegue un'altra operazione, l'«annullamento» viene irrimediabilmente perso.