O comando Cor para alfa deixa transparentes todos os pixels da camada ativa que estão na cor selecionada. Se não existir, um canal alfa será criado. Ele tentará preservar o anti-serrilhamento usando uma rotina semi-inteligente que substitui o uso parcial sobre a cor por transparência parcial. Desta forma, áreas que contém o elemento da cor selecionada manterão uma aparência de continuidade, sem quebras, com os pixels circundantes. É interessante notar que esse feito de transparência parcial permite que a imagem seja vista exatamente como a original, se for colocada sobre um fundo da mesma cor que foi removida com a aplicação do filtro.
Ao clicar no botão de escolha de cores A partir de: aparece um diálogo para escolha de uma cor. Se for necessária a seleção de uma cor exata, você pode usar o conta gotas (ferramenta de seleção de cores), e arrastar a cor escolhida para o botão de escolha de cor. Se você clicar com o botão da direita no botão, terá um menu que permite escolher entre cor de Frente, de Fundo, Preto ou Branco.