El comando «color a alfa» hace transparente todos los píxeles de una capa que tienen un color seleccionado. Se crea un canal alfa. El filtro procurará conservar la información del alisado usando una rutina parcialmente inteligente que reemplaza la información débil de color por la información débil alfa. De esta manera, las áreas que contienen un elemento del color seleccionado mantendrán una apariencia de mezcla con los píxeles circundantes.
Al pulsar sobre Desde del color de muestra se obtienen un diálogo de selección de color en donde se puede seleccionar un color. Si se requiere la selección de un color preciso, use el recoge color, pulse y arrastre el color seleccionado desde el recoge color hasta el color de muestra. Al pulsar con el botón derecho sobre el color se muestra un menú desde donde se puede seleccionar el color de primer plano o el de fondo, blanco o negro.